La gare centrale JR de Matsue est située dans la moitié sud de la ville. Les trains au départ de cette gare permettent de rejoindre d’un côté Tottori ou Okayama (et de là toutes les villes de la côté est dont Tôkyô et Ôsaka), et de l’autre le sud de Shimane (notamment Izumo, les anciennes mines d’argent d’Iwami Ginzan et Tsuwano) et Yamaguchi.